Scanpy: Leitfaden zur Single-Cell-RNA-Sequenzierungsanalyse
Coding Guide: Komplette Single-Cell-RNA-Sequencing-Analyse mit Scanpy Lesezeit: ca. 15 Minuten Key Takeaways Der Leitfaden zeigt, wie eine vollständige Analysepipeline für Single-Cell-RNA-Sequenzierung mit Scanpy aufgebaut wird. Enthalten sind Schritte wie Installation der Bibliotheken, Laden des PBMC 3k Datensatzes, Qualitätskontrolle, Filterung, Normalisierung und Analyse. Nach der Vorprozessierung werden hochvariable Gene identifiziert und eine PCA zur Dimensionsreduktion durchgeführt. […]
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